Biotechnológie a mikroorganizmy

Medzi biotechnológie a mikroorganizmy patria: enzýmy, probiotiká, fermentácia, biologické prípravky

1Meranie expresie vybraných génov v biologických vzorkách – Služba zahŕňa izoláciu RNA, syntézu cDNA, optimalizáciu a realizáciu qPCR reakcií (SYBR Green alebo TaqMan), normalizáciu dát voči referenčným génom a spracovanie výsledkov (Ct hodnoty, relatívna expresia, štatistika). Určená pre biologické vzorky vo forme buniek, tkanív alebo RNA.
Prístrojové vybavenie: Aria MX – Fluorescenčný qPCR prístroj určený na kvantitatívnu analýzu génovej expresie pomocou SYBR Green alebo TaqMan chemie. Prístroj umožňuje detekciu v 96-jamkovom formáte s viacfarebnou detekciou (5 kanálov).
2Služby Zbierky kultúr kvasiniek (CCY – Culture Collection of Yeasts) – Patrí medzi najväčšie zbierky kvasiniek v Európe. Činnosti a služby zbierky: poskytovanie kvasinkových kmeňov pre výskumné aj komerčné využitie, dlhodobá úschova kvasinkových kmeňov, rozširovanie zbierky o nové kmene (izolácia kvasiniek z rôznych prostredí), identifikácia a charakterizácia kvasinkových kmeňov (pre účely zvýšenia efektivity výrobných procesov, pre nastavenie patentových nárokov a pod.), poradenstvo v oblasti taxonómie a nomenklatúry, kultivačných metód a úschovy kvasiniek, ďalšia servisná činnosť podľa dohody, štatút „International Depository Authority“ pre právne chránené kmene pre účely patentového konania.
Prístrojové vybavenie: Zariadenia pre uchovávanie kvasiniek: v kvapalnom dusíku, pod parafínovým olejom, na živných médiách; MALDI-TOF pre identifikáciu kultúr.
3Izolácia a charakterizácia enzýmov – Izolácia, purifikácia a charakterizácia enzýmov zúčastňujúcich sa rozkladu fytomasy podľa požiadaviek zákazníka. Zahŕňa identifikáciu enzýmov pre konkrétnu potrebu výroby, ich izoláciu a analýzu, identifikáciu súvisiacich produkčných mikroorganizmov a vypracovanie podkladov pre ich úpravu za účelom priemyselnej výroby.
Prístrojové vybavenie: HPLC, FPLC, UV-VIS, temperované trepačky, inkubátozy, reverzná osmóza a ďalšie.
4Genetická manipulácia mikroorganizmov – modifikácia mikroorganizmov (kvasiniek a baktérií) za účelom produkcie lipofilných látok (napr. skvalénu, mastných kyselín) ako aj iných metabolitov.
Prístrojové vybavenie: Zariadenia na mikrobiológiu (trepačky, inkubátory, sterilné boxy), molekulárno-genetickú charakterizáciu (PCR cykler, klonovanie, RT-qPCR, DNA/proteínové elektroforézy) a základné analytické vybavenie.
5Služby zbierky mikrobiálnych kultúr – Dlhodobé uchovávanie mikrobiálnych kultúr rizikovej triedy I. v glycerolovom médiu pri -80°C.
Prístrojové vybavenie: Zariadenia pre uchovávanie mikroorganizmov – mraznička -80°C
6Purifikácia proteínov – Produkcia a purifikácia proteínov z rekombinantných baktérií.
Prístrojové vybavenie: FPLC, purifikačné kolóny.
7Meranie expresie génov – Sledovanie transkripcie génov u rôznych druhov mikroorganizmov ako aj bunkových kultúr rizikovej triedy I.
Prístrojové vybavenie: RT-qPCR.
8Kvantifikácia mikrobioty z biologického materiálu a antibiotický fenotypový profil izolovaných bakteriálnych kmeňov – Mikrobiologické vyšetrenie vzoriek biologického materiálu (trus, potraviny a pod.) štandardnou mikrobiologickou metódou podľa ISO noriem. Identifikujú a kvantifikujú sa prítomné bakteriálne rody a určuje sa antibiotický fenotypový profil izolovaných bakteriálnych kmeňov (na ktoré antibiotiká je daná baktéria rezistentná alebo citlivá). Služba je určená najmä pre chovy, využiteľná je aj v rámci humánnej medicíny.
Prístrojové vybavenie: štandardné vybavenie mikrobiologického laboratória.